El Estany de Banyoles cuenta con una gran variedad de vegetación y flora, tanto dentro de sus aguas como rodeando su perímetro. Es un refugio florístico extraordinariamente valioso para las especies hidrófilas –de ambientes acuáticos.

Los nenúfares (Nymphaea alba) son la parte más visible de esta vegetación acuática flotante que encontramos, una decoración natural del Estany de Banyoles que se concentra sobre todo en algunas zonas de la orilla oriental, entre la Oficina de Turismo y las instalaciones de los Banys Vells.